1ère saison
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Artikodin Artikodin est le Pokémon oiseau légendaire de glace.Il vit dans les somments enneigés, où ils aident les alpinistes. Il maitrise la glace grâce à ses ailes. Ses formes font de lui le plus magnifique des Pokémon légendaires.
Electhor Electhor est le Pokémon oiseau légendaire de la foudre. Il vit dans les nuages où il se régénère en électricité qui lui permet de manipuler la foudre.
Sulfura Sulfura est le Pokémon oiseau légendaire de feu. Il aime jouer avec le feu et quand il est blessé, il va se régénérer dans les volcans où la lave guérit ses blessures.
Mewtwo Mewtwo est sans doute, aux yeux de tout le monde, le plus puissant Pokémon qu'il n'ait jamais existé. Il a été créé par l'ADN de Mew et possède donc le même code génétique que lui. Il possède des pouvoirs psychiques puissants pour se débarasser de ses adversaires.
Mew Mew est le Pokémon le plus recherché encore à nos jours. Il peut apprendre toutes les CT/CS des jeux, ce qui fait de lui le 2nd plus puissant Pokémon. On pourrait le nommé le "couteau suisse Pokémon".

2ème saison
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Raïkou Raïkou est le Pokémon chien légendaire de la foudre. Il stocke dans son corps une charge électrique énorme. Le nuage qu'il porte sur son dos peut produire des ondes de choc semblable à des orages.
Enteï Enteï est le Pokémon chien légendaire de feu. Il peut cracher des flammes et déclancher des éruptions volcaniques.
Suicune Suicune est le Pokémon chien légendaire de l'eau. Il peut purifier l'eau et lutter contre la pollution.Il peut déclancher des immenses tsunamis si on le provoque.
Ho-oh Ho-oh est le 2nd Pokémon oiseau légendaire de feu. Il peut prédire l'avenir et annoce une ère de paix entre les humains et les Pokémon. Si on s'en prend à sa légende, il serait à l'origine de la résurrection des chiens légendaires.
Lugia Lugia est un Pokémon légendaire Eau/Psy. Il est le Gardien des 7 mers et veille à la survie des Pokémons oiseaux légendaires de la 1ère saison.
Célébi Célébi est le Pokémon légendaire de type Psy capable de traverser le temps. Il annonce aussi le présage d'un avenir merveilleux.

3ème saison
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Regice Regice est le golem légendaire de glace. Il est apparu à l'ère glacaire. La glace qui le compose se trouve en Antarctique. Autour de lui, il maintient en activité une couche d'air de -273°C, qui gèle tout ce qui approche.
Regirock Regirock est le golem légendaire de pierre. Il est apparu à l'age de pierre d'après la légende. Son corps entier est taillé dans la roche, et il est capable de se reconstituer si il arrive à se blesser, grâce aux minéraux qu'il peut trouver sur son chemin.
Registeel Registeel est le golem légendaire de l'acier. Il est le plus récent des Regis et son corps est fait d'un alliage d'origine inconnue (certains disent que c'est un allige extraterrestre), très résistant et d'une souplesse... Le temps qu'il a passé dans sa grotte lui a permis de renforcer son organisme.
Latias Latias possède des pouvoirs télépathiques qui lui permettent de lire dans les pensées des humains et des Pokémon. Elle peut se rendre invisible ou encore prendre l'apparence d'un humain grâce au symbole de son torse.
Latios Latios est comme sa sœur, mais ses pouvoirs sont plus puissants, et il résiste plus longtemps que cette dernière. Il maitrise la propulsion à grande vitesse.
Kyogre Kyogre est le Pokémon légendaire de l'eau. Il détient en lui le pouvoir des océans, ce qui fait qu'il peut provoquer des inondations et des déluges. La Team Aqua le recherche pour étendre son pouvoir avec la mer.
Groudon Groudon est le Pokémon légendaire de la terre. Il détient en lui le pouvoir de la terre, ce qui fait qu'il peut provoquer des éruptions volcaniques et des sécheresses. La Team Magma le recherche pour étendre son pouvoir avec la terre.
Rayquaza Rayquaza est le Pokémon légendaire des cieux, car il vit au niveau de la couche d'ozone. Il connait selon la légende, toutes les capacités connues des Pokémon et à le pouvoir de changer le climat à sa guise. Si Kyogre et Groudon venaient à s'affronter, il serait le seul à pouvoir les calmer.
Jirachi Jirachi est un Pokémon légendaire capable de léviter, mais il connait aussi les techniques de télékinésie et de téléportation. Selon la légende, celui qui, grâce à son chant le plus pur, pourra le tirer de son sommeiil et verrait son vœu le plus cher s'exaucer.
Deoxys Deoxys est un Pokémon apparu lors de son exposition sous son aspect initial (un virus) à un rayon laser. Son cerveau se trouve dans l'orbe qui se situe sur sa poitrine. Il est d'une puissance force mentale, mais sa résistance est très faible.

4ème saison
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Créhelf Être de Connaissance, il est l'un des trois Pokémon emprisonnant Palkia et Dialga. Il sera d'ailleurs volé par la Team Galaxie afin de libérer ces derniers.
Créfollet Être de Vérité, il est l'un des trois Pokémon emprisonnant Palkia et Dialga. Il sera d'ailleurs volé par la Team Galaxie afin de libérer ces derniers.
Créfadet Être de Courage, il est l'un des trois Pokémon emprisonnant Palkia et Dialga. Il sera d'ailleurs volé par la Team Galaxie afin de libérer ces derniers.
Dialga Pokémon maître du temps, il a le pouvoir de le modifier à sa convenance. Lorsque les trois Cré's ont été réunis par la Team Galaxie, il est apparu entre les pilliers célestes.
Palkia Pokémon maître de l'espace, il a le pouvoir d'en faire son jouet. Lorsque les trois Cré's ont été réunis par la Team Galaxie, il est apparu entre les pilliers celestes.
Heatran Il est un des seuls Pokémon légendaires à pouvoir être identifié à un sexe, il est également le Pokémon gardien des volcans.
Regigigas Lorsque les trois golems sont réunis devant la statue de Regigigas, celui s'éveille. Regigigas est un fait tout simplement le maître des trois golems...
Giratina Il est le Dieu des dimensions, la matérialisation des pouvoirs de Dialga et Palkia, il vient d'un autre monde et tient rôle de passeur entre les deux.
Cresselia Cresselia est la reine des rêves, idéalement opposée à Darkrai. Elle sommeille sur l'Île de la Lune, en attendant un réveil et de nouveaux esprits à hanter.
Phione Le petit prince des mers, pré-évolution de Manaphy, est le seul Pokémon légendaire capable de se reproduire.
Manaphy Manaphy le prince des mers est le seul Pokémon légendaire à être capable de se reproduire, créant de ce fait Phione.
Darkrai Pokémon des cauchemards, il hante les esprits, et apporte le chaos sur terre, il est idéalement opposé à Cresselia.
Shaymin L'esprit des fleurs entretient la nature et passe son temps à la défendre.
Arceus Le Dieu des Pokémon. En est par conséquent le plus puissant, capable de tout contrôler et de changer de forme à volonté, il incarne la puissance à l'état pur.